太陽系的邊界分為多個層次，傳統的行星軌道界限在海王星之后，太陽風的邊界是日球層頂，太陽引力的最遠邊界則是奧爾特云，真實情況往往比想象得更加復雜，太陽系的邊界要從這三個角度考慮。
行星軌道邊界
人們長期將海王星視作太陽系最遠的一顆行星，但1992年科學家在海王星之外的柯伊伯帶中發現了1992QB1，這顆行星也在圍繞太陽公轉，這意味著太陽系的范圍可能比人類之前想象得更龐大，這一發現導致2006年國際天文學聯合會重新對行星的標準進行了修正，修正之后冥王星不再屬于行星。
太陽風的邊界
日球層頂是太陽風塑造起來的邊界，這是太陽影響力的外援，太陽風就是太陽大氣最外層釋放出來的帶電粒子流，這些粒子流到達日球層頂時會由于和星際介質的作用，運動速度逐漸減慢，日球層頂仿佛一個天然屏障，將大部分高能粒子都阻擋開來。日球層的大小和形狀并不是固定的，它會跟隨太陽周期的變化產生變化，這也導致太陽系邊界的定義變得更加模糊。
太陽引力的最遠界限
奧爾特云是太陽系最遠的邊界，在這個范圍之外的天體不再受到太陽的引力作用，這一天體集群位于太陽系中心向外50000到150000AU的區域，主要的組成部分就是彗星。這些天體遠離太陽，幾乎不受到太陽光能量的影響，仍然維持著太陽系形成初期的原始物質狀態。奧爾特云的彗星運動軌道呈橢圓形，這些彗星被恒星附近的引力或者銀河潮汐力擾動時，可能會被拋向太陽，形成長周期彗星。
除上面提到的幾種定義，柯伊伯帶的位置也被人們認為是太陽系的另外一種邊界，未來隨太空探索相關技術的發展，可能對于太陽系的邊界會得出更加復雜的定義。
